Retsforfølgelse af israelske bosættere sker primært gennem det israelske retssystem. Når en voldelig hændelse finder sted, er det det israelske politi, der formelt skal efterforske sagen. Hvis politiet vælger at rejse tiltale, føres sagen ved de israelske domstole, som har jurisdiktion over israelske statsborgere i de besatte områder.
I praksis møder ofrene dog ofte massive barrierer. Rapporter fra menneskerettighedsorganisationer viser, at politiet sjældent rykker hurtigt ud til angreb i landsbyer. Mange sager ender med at blive lukket uden sigtelse. Det skyldes både manglende efterforskning på stedet og en generel mangel på vilje til at retsforfølge bosættere. Dette skaber en følelse af straffrihed i mange lokalsamfund.
Der findes også internationale mekanismer. Den Internationale Straffedomstol (ICC) undersøger situationen i Palæstina. De fokuserer på krigsforbrydelser, hvilket kan omfatte vold begået af bosættere, hvis handlingerne falder under deres mandat. Men ICC's arbejde er langsommeligt og politisk komplekst. Selvom de juridiske veje findes på papiret, er de reelle konsekvenser for gerningsmændene ofte begrænsede i det daglige liv på jorden.
