Når flagermusbestanden falder, opstår der en ubalance i de naturlige økosystemer. Flagermus fungerer som vigtige naturlige regulatorer, da de lever af enorme mængder insekter. Hvis disse populationer kollapser, for eksempel på grund af svampesygdomme som White-Nose Syndrome, forsvinder en af naturens mest effektive metoder til naturlig skadedyrsbekæmpelse.
Dette fald fører direkte til en øget afhængighed af syntetiske insekticider. Når de naturlige fjender af skadedyr forsvinder, må mennesker i højere grad ty til kemisk bekæmpelse for at beskytte afgrøder. Undersøgelser viser, at et fald i insektspisende flagermus har medført en markant stigning i pesticidforbruget, hvilket skaber en negativ spiral for biodiversiteten.
For at modvirke denne udvikling anbefales det at inkludere flagermus i risikovurderinger ved brug af pesticider. Det er vigtigt at undgå problematiske midler nær naturområder med flagermusebeskyttelse. Selvom der findes løsninger til at kontrollere flagermusbestande i haver eller landbrug, er bevarelsen af de naturlige populationer den mest bæredygtige og effektive strategi for at holde pesticidforbruget nede og beskytte miljøet.
