Sekundære eksplosioner ved et våbenlager kan frigive en række komplekse kemiske forbindelser til det omgivende miljø. De primære restprodukter stammer fra nedbrydningen af krudt og sprængstoffer, hvilket ofte resulterer i udslip af nitrogenoxider, svovldioxid og kulilte. Disse gasser kan medføre lokal luftforurening og bidrage til dannelsen af syreregn, som påvirker både jordens surhedsgrad og vandløb i nærområdet.
Ved eksplosioner frigives også tungmetaller som bly, kviksølv og barium, der findes i patronhylstre og tændsatser. Disse metaller er persistente, hvilket betyder, at de ikke nedbrydes i naturen, men i stedet ophobes i jordlagene og i de levende organismer gennem fødekæden. Dette kan føre til biotoksicitet, som skader det lokale dyreliv og potentielt forurener grundvandet gennem udvaskning.
Partikelspredning er en anden kritisk faktor. Eksplosionerne kan sende finstøv og kemiske partikler langt væk fra selve epicentret. Disse partikler kan deponeres på vegetation og i vandmiljøer, hvilket forstyrrer den naturlige kemiske balance i økosystemet og kan have langvarige konsekvenser for biodiversiteten i det berørte område.